MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp6

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021978	GCATCG	2	12	1258	1269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529218771
2	NC_021978	CTT	2	6	1277	1282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218771
3	NC_021978	GCC	2	6	1288	1293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218771
4	NC_021978	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218771
5	NC_021978	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218771
6	NC_021978	CTT	2	6	1358	1363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218772
7	NC_021978	GGCG	2	8	1540	1547	0 %	0 %	75 %	25 %	529218772
8	NC_021978	GGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218772
9	NC_021978	ACT	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218772
10	NC_021978	TGA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218772
11	NC_021978	GAG	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218772
12	NC_021978	CAGC	2	8	1690	1697	25 %	0 %	25 %	50 %	529218772
13	NC_021978	GAT	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218772
14	NC_021978	GCT	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
15	NC_021978	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218773
16	NC_021978	CTG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
17	NC_021978	CAG	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218773
18	NC_021978	TAA	2	6	3223	3228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218773
19	NC_021978	GAT	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218773
20	NC_021978	CTT	3	9	3425	3433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218773
21	NC_021978	TG	3	6	3454	3459	0 %	50 %	50 %	0 %	529218773
22	NC_021978	T	6	6	3534	3539	0 %	100 %	0 %	0 %	529218773
23	NC_021978	GAG	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218773
24	NC_021978	TGC	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
25	NC_021978	T	6	6	3567	3572	0 %	100 %	0 %	0 %	529218773
26	NC_021978	CTG	3	9	3573	3581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
27	NC_021978	CGC	2	6	3639	3644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218773
28	NC_021978	TCT	3	9	3647	3655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218773
29	NC_021978	G	6	6	3667	3672	0 %	0 %	100 %	0 %	529218773
30	NC_021978	AG	3	6	3736	3741	50 %	0 %	50 %	0 %	529218773
31	NC_021978	CGA	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218773
32	NC_021978	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218773
33	NC_021978	T	6	6	3808	3813	0 %	100 %	0 %	0 %	529218773
34	NC_021978	TGAT	2	8	3835	3842	25 %	50 %	25 %	0 %	529218773
35	NC_021978	AAT	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218773
36	NC_021978	TTGCT	2	10	4638	4647	0 %	60 %	20 %	20 %	529218774
37	NC_021978	TTA	2	6	4684	4689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218774
38	NC_021978	T	6	6	4705	4710	0 %	100 %	0 %	0 %	529218774
39	NC_021978	CA	3	6	4757	4762	50 %	0 %	0 %	50 %	529218774
40	NC_021978	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218775
41	NC_021978	AAG	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218775
42	NC_021978	AATC	2	8	4864	4871	50 %	25 %	0 %	25 %	529218775
43	NC_021978	TCA	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218775
44	NC_021978	GCT	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218775
45	NC_021978	T	6	6	4930	4935	0 %	100 %	0 %	0 %	529218775
46	NC_021978	CT	3	6	5032	5037	0 %	50 %	0 %	50 %	529218775
47	NC_021978	CATAA	2	10	5096	5105	60 %	20 %	0 %	20 %	529218775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.